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通常大部分口腔溃疡不会遗传，但复发性口腔溃疡，一般指复发性阿弗他溃疡，有家族遗传倾向。有研究报道，部分临床上诊断为复发性阿弗他溃疡的患者，经过询问会发现其父母、祖父母或外祖父母，均会存在部分同样病情、病史的情况。此外，有家族倾向的复发性阿弗他溃疡患者，其溃疡的严重程度也相对较重。
另外也有统计发现，如果父母双方均为复发性阿弗他溃疡患者，子女便有50%-90%的可能性会发生复发性阿弗他溃疡。父母一方有复发性阿弗他溃疡，子女发生几率便有50%-60%。父母双方均没有复发性阿弗他溃疡病史，子女患复发性阿弗他溃疡的几率便仅有20%。
